MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510c

Total Repeats: 1636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013857	TCC	2	6	601785	601790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_013857	GCT	2	6	601798	601803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_013857	GCG	2	6	601961	601966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_013857	GCG	2	6	601988	601993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_013857	GGGC	2	8	602037	602044	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_013857	CCT	2	6	605432	605437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_013857	CTT	2	6	605442	605447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_013857	TCC	2	6	605477	605482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_013857	G	6	6	605518	605523	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_013857	ATT	2	6	609124	609129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013857	CGC	2	6	609138	609143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_013857	CGC	2	6	609187	609192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_013857	ATT	2	6	609195	609200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_013857	GAA	2	6	609295	609300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_013857	GCGG	2	8	609324	609331	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_013857	GCT	2	6	610910	610915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_013857	CGG	2	6	611849	611854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_013857	CGC	2	6	611917	611922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_013857	CAATC	2	10	611975	611984	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1520	NC_013857	CACG	2	8	611985	611992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_013857	GAG	2	6	612026	612031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_013857	CGA	2	6	612054	612059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_013857	AAT	2	6	612068	612073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_013857	ATT	2	6	612088	612093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_013857	CGT	2	6	612170	612175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_013857	GCG	2	6	612188	612193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_013857	CCG	2	6	612200	612205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_013857	CCCCG	2	10	615315	615324	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1529	NC_013857	CCGG	2	8	615343	615350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_013857	ATG	2	6	615374	615379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_013857	TCT	2	6	615946	615951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_013857	GCC	2	6	615965	615970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_013857	GAC	2	6	615973	615978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_013857	CAAA	2	8	615989	615996	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_013857	GAC	2	6	618730	618735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_013857	GGAA	2	8	618779	618786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013857	CGC	2	6	618799	618804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_013857	TCCG	2	8	618806	618813	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_013857	CGTCG	2	10	618849	618858	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1540	NC_013857	AAAC	2	8	618926	618933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_013857	CTG	2	6	620378	620383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_013857	AGC	3	9	620496	620504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_013857	CGT	2	6	620651	620656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_013857	CG	3	6	620681	620686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_013857	GGC	2	6	620702	620707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_013857	GAA	2	6	620733	620738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_013857	GCCC	2	8	622788	622795	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1548	NC_013857	C	6	6	622793	622798	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1549	NC_013857	GCC	2	6	622878	622883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_013857	TC	3	6	624069	624074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_013857	AC	3	6	624075	624080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_013857	GCC	2	6	624112	624117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_013857	TAC	2	6	624215	624220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_013857	GCC	2	6	624329	624334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_013857	GCC	2	6	624710	624715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_013857	CACC	2	8	624723	624730	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1557	NC_013857	CCG	2	6	624734	624739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_013857	CTCC	2	8	625706	625713	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1559	NC_013857	CAA	2	6	625721	625726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_013857	GCGG	2	8	626418	626425	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_013857	CGG	2	6	626428	626433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_013857	GACGCC	2	12	627961	627972	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_013857	GCC	2	6	628005	628010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_013857	GCG	2	6	631517	631522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_013857	GCG	2	6	634423	634428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_013857	G	6	6	634436	634441	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_013857	GCC	2	6	634443	634448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_013857	GCG	2	6	634449	634454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_013857	GAC	2	6	634502	634507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_013857	GATG	2	8	634540	634547	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013857	AC	3	6	636418	636423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_013857	ATGG	2	8	636456	636463	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_013857	CCCT	2	8	637410	637417	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1574	NC_013857	CGC	2	6	637435	637440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_013857	T	6	6	637444	637449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_013857	GCG	2	6	637492	637497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_013857	CGC	2	6	637513	637518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_013857	CGC	2	6	641637	641642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_013857	GCC	2	6	641649	641654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_013857	ACCG	2	8	641655	641662	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_013857	CGG	2	6	641686	641691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_013857	CCG	2	6	641696	641701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_013857	GCG	2	6	641707	641712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_013857	CG	3	6	641731	641736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_013857	ACGC	2	8	643438	643445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_013857	GCCAA	2	10	643459	643468	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1587	NC_013857	AACG	2	8	643554	643561	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_013857	G	6	6	643568	643573	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_013857	TGG	2	6	646186	646191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_013857	TCC	2	6	648542	648547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_013857	ACC	2	6	648604	648609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_013857	CCG	2	6	648675	648680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_013857	GGC	2	6	649715	649720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_013857	GCC	2	6	649727	649732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_013857	CGGG	2	8	651420	651427	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1596	NC_013857	CCCG	2	8	651484	651491	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1597	NC_013857	AACC	2	8	660081	660088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_013857	GC	3	6	660098	660103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_013857	CGGGA	2	10	660222	660231	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1600	NC_013857	GCC	2	6	660234	660239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_013857	TCC	3	9	660281	660289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_013857	GCG	2	6	662443	662448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_013857	CTT	2	6	662864	662869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_013857	ATC	2	6	664353	664358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_013857	CGG	2	6	664383	664388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_013857	CGGC	2	8	664398	664405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_013857	CGG	3	9	666815	666823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_013857	CGA	2	6	666836	666841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_013857	CGG	2	6	666845	666850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_013857	CTG	2	6	666924	666929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_013857	CTC	2	6	666942	666947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_013857	GCA	2	6	666989	666994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_013857	GCC	2	6	667038	667043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_013857	CGGCG	2	10	667058	667067	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1615	NC_013857	GGC	2	6	667073	667078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_013857	GGA	2	6	667080	667085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_013857	TCC	2	6	667087	667092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_013857	GCG	2	6	670098	670103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_013857	GCGG	2	8	670113	670120	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_013857	GTC	2	6	670263	670268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_013857	CTAA	2	8	670331	670338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_013857	CG	3	6	670417	670422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_013857	CAT	2	6	670441	670446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_013857	CCGG	2	8	673209	673216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_013857	CCG	2	6	675435	675440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_013857	A	6	6	675453	675458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_013857	TCA	2	6	675481	675486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_013857	CCG	2	6	675492	675497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_013857	TGA	2	6	677738	677743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_013857	C	6	6	677754	677759	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1631	NC_013857	G	6	6	677769	677774	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_013857	AACC	2	8	677775	677782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_013857	CCG	2	6	677791	677796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_013857	CCCCTT	2	12	679254	679265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_013857	CGG	2	6	680428	680433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_013857	GCC	2	6	680465	680470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.